As plantas assimilam o CO2 e, na presença da água, dos nutrientes e da energia solar, transformam o gás em compostos de carbono (carbohidratos, proteínas e celulose), liberando O2.
No solo, a matéria orgânica, transformada em húmus, com propriedades coloidais, auxilia na formação dos agregados, melhorando as características físicas (permeabilidade, porosidade, retenção da água, resistência à erosão, etc).
Bactérias nitrificantes, que se alimentam da matéria orgânica, mineralizam e fixam o N no solo (NH4+ e NO3-), que serão absorvidos pelas plantas. 78% do ar nos solos é composto de Nitrogênio não biodisponível, que depende da atuação dos microrganismos para fixar o N nos colóides e na água do solo. Também a fermentação dos detritos orgânicos libera gás amoníaco que transforma-se no íon amônio (NH4+) que dissolve-se na água.
